Im wyższa jest temperatura przechowalni, tym szybsza utrata C02, a co za tym idzie wzrost pH. Podczas przechowywania jaj C03 dyfunduje przez skorupę do momentu osiągnięcia równowagi z dwutlenkiem węgla w powietrzu. Jajo można częściowo zabezpieczyć przed utratą C02 przez dodanie tego gazu do powietrza w przechowalni. Opóźnia to zmiany pH, hamuje rozwój drobnoustrojów, słabnięcie błony witelinowej żółtka oraz obniżenie smakowitości .jaja.Niekiedy przyczyną zmian zachodzących podczas starzenia się jaja jest zakażenie bakteryjne. Świeżo zniesione jajo jest wewnątrz sterylne, ale już podczas stygnięcia drobnoustroje mogą przenikać przez skorupę, zwłaszcza gdy jest ona uszkodzona. Możliwość zakażenia drobnoustrojami rośnie, gdy jajo jest brudne i następnie myte. Bakterie po wniknięciu pod skorupę napotykają niekorzystne dla ich rozwoju środowisko, które stanowią: błona podskorupowa, alkaliczne pH i lizozym. Ten ostatni jest enzymem hydrolizującym polisacharyd zawierający kwas muraminowy. Lizozym rozkładając ten składnik ułatwia pękanie komórek bakteryjnych powodując ich zniszczenie. Składowanie jaj w chłodni o odpowiednio obniżonej temperaturze i właściwej wilgotności powietrza umożliwia zachowanie jakości produktu na czas kilku miesięcy. Lowe [16] podaje jako optymalną temperaturę przechowywania jaja od — 1,1°C do 1,8°C przy wilgotności względnej w granicach 80—85% i 4—5-krotnej wymianie powietrza w ciągu godziny.